Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LHX2P50458 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX2P50458 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX2P50458 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX2P50458 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX2P50458 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX2P50458 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX2P50458 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX2P50458 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LHX2P50458 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX2P50458 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX2P50458 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX2P50458 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX2P50458 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX2P50458 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX2P50458 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LHX2P50458 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX2P50458 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX2P50458 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX2P50458 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LHX2P50458 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX2P50458 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX2P50458 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX2P50458 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX2P50458 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX2P50458 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LHX2P50458 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX2P50458 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX2P50458 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX2P50458 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX2P50458 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX2P50458 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX2P50458 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LHX2P50458 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LHX2P50458 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX2P50458 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX2P50458 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX2P50458 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX2P50458 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX2P50458 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX2P50458 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX2P50458 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX2P50458 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX2P50458 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX2P50458 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX2P50458 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LHX2P50458 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX2P50458 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX2P50458 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX2P50458 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LHX2P50458 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX2P50458 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX2P50458 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX2P50458 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX2P50458 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX2P50458 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LHX2P50458 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX2P50458 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX2P50458 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX2P50458 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX2P50458 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX2P50458 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX2P50458 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX2P50458 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX2P50458 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LHX2P50458 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX2P50458 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX2P50458 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX2P50458 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX2P50458 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX2P50458 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LHX2P50458 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX2P50458 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX2P50458 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX2P50458 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX2P50458 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX2P50458 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX2P50458 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX2P50458 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX2P50458 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LHX2P50458 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX2P50458 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX2P50458 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX2P50458 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX2P50458 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX2P50458 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX2P50458 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX2P50458 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX2P50458 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX2P50458 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX2P50458 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX2P50458 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX2P50458 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX2P50458 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX2P50458 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX2P50458 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX2P50458 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX2P50458 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX2P50458 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX2P50458 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms