Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GATMP50440 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GATMP50440 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GATMP50440 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GATMP50440 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GATMP50440 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GATMP50440 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GATMP50440 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GATMP50440 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GATMP50440 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GATMP50440 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GATMP50440 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATMP50440 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATMP50440 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATMP50440 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATMP50440 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATMP50440 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATMP50440 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATMP50440 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GATMP50440 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATMP50440 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATMP50440 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GATMP50440 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GATMP50440 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GATMP50440 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GATMP50440 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GATMP50440 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GATMP50440 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATMP50440 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATMP50440 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATMP50440 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATMP50440 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATMP50440 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATMP50440 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATMP50440 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATMP50440 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATMP50440 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GATMP50440 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GATMP50440 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GATMP50440 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GATMP50440 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GATMP50440 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GATMP50440 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GATMP50440 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GATMP50440 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GATMP50440 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GATMP50440 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GATMP50440 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GATMP50440 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GATMP50440 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GATMP50440 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GATMP50440 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GATMP50440 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
GATMP50440 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GATMP50440 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
GATMP50440 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GATMP50440 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GATMP50440 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GATMP50440 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GATMP50440 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GATMP50440 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GATMP50440 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GATMP50440 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GATMP50440 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GATMP50440 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GATMP50440 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GATMP50440 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GATMP50440 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GATMP50440 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GATMP50440 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GATMP50440 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GATMP50440 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GATMP50440 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GATMP50440 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GATMP50440 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GATMP50440 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GATMP50440 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GATMP50440 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GATMP50440 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GATMP50440 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GATMP50440 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GATMP50440 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GATMP50440 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GATMP50440 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GATMP50440 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GATMP50440 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GATMP50440 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GATMP50440 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GATMP50440 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GATMP50440 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GATMP50440 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GATMP50440 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GATMP50440 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GATMP50440 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GATMP50440 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GATMP50440 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GATMP50440 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GATMP50440 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GATMP50440 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GATMP50440 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms