Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTPAP49638 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTPAP49638 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTPAP49638 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TTPAP49638 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTPAP49638 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TTPAP49638 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTPAP49638 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTPAP49638 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTPAP49638 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TTPAP49638 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTPAP49638 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTPAP49638 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTPAP49638 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTPAP49638 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTPAP49638 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTPAP49638 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TTPAP49638 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTPAP49638 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTPAP49638 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TTPAP49638 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTPAP49638 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTPAP49638 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTPAP49638 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTPAP49638 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TTPAP49638 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TTPAP49638 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTPAP49638 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTPAP49638 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTPAP49638 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TTPAP49638 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TTPAP49638 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTPAP49638 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTPAP49638 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTPAP49638 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TTPAP49638 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TTPAP49638 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTPAP49638 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTPAP49638 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TTPAP49638 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTPAP49638 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTPAP49638 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTPAP49638 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TTPAP49638 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TTPAP49638 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTPAP49638 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTPAP49638 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTPAP49638 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTPAP49638 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTPAP49638 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TTPAP49638 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTPAP49638 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TTPAP49638 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTPAP49638 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TTPAP49638 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTPAP49638 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTPAP49638 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTPAP49638 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTPAP49638 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTPAP49638 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TTPAP49638 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTPAP49638 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTPAP49638 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTPAP49638 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TTPAP49638 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TTPAP49638 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TTPAP49638 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTPAP49638 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTPAP49638 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTPAP49638 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTPAP49638 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTPAP49638 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTPAP49638 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTPAP49638 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TTPAP49638 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TTPAP49638 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTPAP49638 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TTPAP49638 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTPAP49638 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TTPAP49638 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TTPAP49638 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTPAP49638 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTPAP49638 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTPAP49638 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTPAP49638 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTPAP49638 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTPAP49638 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTPAP49638 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTPAP49638 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TTPAP49638 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTPAP49638 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTPAP49638 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTPAP49638 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTPAP49638 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTPAP49638 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TTPAP49638 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTPAP49638 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTPAP49638 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTPAP49638 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TTPAP49638 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
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