Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPFP49454 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPFP49454 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPFP49454 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPFP49454 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPFP49454 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPFP49454 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPFP49454 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CENPFP49454 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPFP49454 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPFP49454 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPFP49454 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPFP49454 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CENPFP49454 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CENPFP49454 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CENPFP49454 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPFP49454 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPFP49454 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPFP49454 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPFP49454 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPFP49454 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPFP49454 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CENPFP49454 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPFP49454 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPFP49454 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CENPFP49454 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPFP49454 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPFP49454 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPFP49454 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPFP49454 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPFP49454 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPFP49454 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPFP49454 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPFP49454 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPFP49454 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPFP49454 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPFP49454 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPFP49454 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPFP49454 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPFP49454 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPFP49454 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPFP49454 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPFP49454 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPFP49454 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPFP49454 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPFP49454 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPFP49454 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CENPFP49454 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CENPFP49454 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPFP49454 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPFP49454 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPFP49454 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CENPFP49454 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CENPFP49454 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CENPFP49454 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPFP49454 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPFP49454 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPFP49454 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPFP49454 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CENPFP49454 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPFP49454 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPFP49454 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPFP49454 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPFP49454 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPFP49454 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPFP49454 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPFP49454 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPFP49454 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPFP49454 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPFP49454 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPFP49454 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPFP49454 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPFP49454 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CENPFP49454 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPFP49454 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPFP49454 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPFP49454 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPFP49454 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CENPFP49454 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPFP49454 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPFP49454 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPFP49454 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPFP49454 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPFP49454 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPFP49454 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPFP49454 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPFP49454 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPFP49454 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPFP49454 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPFP49454 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPFP49454 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPFP49454 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPFP49454 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CENPFP49454 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPFP49454 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPFP49454 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CENPFP49454 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPFP49454 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPFP49454 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CENPFP49454 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms