Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PIP4K2AP48426 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.53
PIP4K2AP48426 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PIP4K2AP48426 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PIP4K2AP48426 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.1 ms