Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX3P48380 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX3P48380 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RFX3P48380 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX3P48380 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX3P48380 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX3P48380 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX3P48380 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RFX3P48380 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX3P48380 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RFX3P48380 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX3P48380 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX3P48380 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX3P48380 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX3P48380 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX3P48380 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RFX3P48380 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX3P48380 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX3P48380 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX3P48380 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX3P48380 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX3P48380 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX3P48380 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX3P48380 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX3P48380 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX3P48380 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX3P48380 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX3P48380 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RFX3P48380 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX3P48380 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX3P48380 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX3P48380 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX3P48380 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX3P48380 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX3P48380 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX3P48380 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX3P48380 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX3P48380 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX3P48380 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX3P48380 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX3P48380 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX3P48380 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX3P48380 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX3P48380 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX3P48380 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX3P48380 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX3P48380 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX3P48380 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX3P48380 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX3P48380 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX3P48380 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX3P48380 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX3P48380 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX3P48380 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX3P48380 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX3P48380 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX3P48380 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX3P48380 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX3P48380 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX3P48380 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX3P48380 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX3P48380 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RFX3P48380 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX3P48380 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX3P48380 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX3P48380 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX3P48380 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX3P48380 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX3P48380 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX3P48380 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX3P48380 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX3P48380 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX3P48380 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX3P48380 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX3P48380 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX3P48380 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX3P48380 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX3P48380 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX3P48380 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX3P48380 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX3P48380 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX3P48380 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX3P48380 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX3P48380 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX3P48380 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX3P48380 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX3P48380 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX3P48380 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX3P48380 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX3P48380 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX3P48380 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX3P48380 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX3P48380 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX3P48380 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX3P48380 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX3P48380 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX3P48380 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX3P48380 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX3P48380 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX3P48380 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms