Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ME1P48163 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ME1P48163 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ME1P48163 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ME1P48163 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ME1P48163 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ME1P48163 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ME1P48163 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ME1P48163 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ME1P48163 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ME1P48163 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ME1P48163 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ME1P48163 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ME1P48163 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ME1P48163 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ME1P48163 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ME1P48163 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ME1P48163 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ME1P48163 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ME1P48163 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ME1P48163 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ME1P48163 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ME1P48163 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ME1P48163 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ME1P48163 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ME1P48163 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ME1P48163 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ME1P48163 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ME1P48163 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ME1P48163 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ME1P48163 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ME1P48163 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ME1P48163 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ME1P48163 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ME1P48163 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ME1P48163 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ME1P48163 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ME1P48163 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME1P48163 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME1P48163 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME1P48163 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ME1P48163 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME1P48163 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME1P48163 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ME1P48163 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME1P48163 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME1P48163 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME1P48163 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME1P48163 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME1P48163 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME1P48163 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ME1P48163 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ME1P48163 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ME1P48163 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ME1P48163 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ME1P48163 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ME1P48163 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ME1P48163 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ME1P48163 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ME1P48163 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ME1P48163 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME1P48163 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME1P48163 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME1P48163 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME1P48163 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME1P48163 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ME1P48163 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ME1P48163 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME1P48163 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME1P48163 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME1P48163 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME1P48163 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME1P48163 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME1P48163 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME1P48163 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME1P48163 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME1P48163 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ME1P48163 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ME1P48163 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ME1P48163 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ME1P48163 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ME1P48163 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ME1P48163 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ME1P48163 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ME1P48163 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ME1P48163 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ME1P48163 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ME1P48163 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ME1P48163 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ME1P48163 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ME1P48163 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ME1P48163 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ME1P48163 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ME1P48163 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME1P48163 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME1P48163 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME1P48163 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME1P48163 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME1P48163 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ME1P48163 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms