Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GATA4P43694 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATA4P43694 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATA4P43694 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GATA4P43694 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATA4P43694 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATA4P43694 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATA4P43694 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATA4P43694 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATA4P43694 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATA4P43694 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATA4P43694 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GATA4P43694 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATA4P43694 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GATA4P43694 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATA4P43694 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATA4P43694 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATA4P43694 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATA4P43694 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATA4P43694 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATA4P43694 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATA4P43694 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
GATA4P43694 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATA4P43694 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATA4P43694 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATA4P43694 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GATA4P43694 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATA4P43694 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GATA4P43694 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATA4P43694 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATA4P43694 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATA4P43694 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GATA4P43694 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GATA4P43694 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GATA4P43694 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATA4P43694 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATA4P43694 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GATA4P43694 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATA4P43694 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATA4P43694 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GATA4P43694 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GATA4P43694 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATA4P43694 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GATA4P43694 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GATA4P43694 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATA4P43694 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATA4P43694 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATA4P43694 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GATA4P43694 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATA4P43694 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATA4P43694 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATA4P43694 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATA4P43694 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATA4P43694 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATA4P43694 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATA4P43694 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATA4P43694 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATA4P43694 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATA4P43694 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GATA4P43694 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATA4P43694 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATA4P43694 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATA4P43694 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATA4P43694 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATA4P43694 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATA4P43694 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATA4P43694 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GATA4P43694 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA4P43694 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA4P43694 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA4P43694 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA4P43694 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA4P43694 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA4P43694 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA4P43694 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA4P43694 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GATA4P43694 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA4P43694 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA4P43694 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA4P43694 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA4P43694 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA4P43694 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA4P43694 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA4P43694 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA4P43694 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA4P43694 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA4P43694 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GATA4P43694 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA4P43694 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA4P43694 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA4P43694 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA4P43694 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA4P43694 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GATA4P43694 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA4P43694 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA4P43694 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA4P43694 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA4P43694 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA4P43694 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GATA4P43694 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms