Protein–RNA interactions for Protein: P43405

SYK, Tyrosine-protein kinase SYK, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYKP43405 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYKP43405 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYKP43405 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYKP43405 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYKP43405 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SYKP43405 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYKP43405 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYKP43405 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYKP43405 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYKP43405 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SYKP43405 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYKP43405 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SYKP43405 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYKP43405 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SYKP43405 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYKP43405 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYKP43405 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SYKP43405 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SYKP43405 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYKP43405 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYKP43405 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYKP43405 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SYKP43405 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYKP43405 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SYKP43405 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYKP43405 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYKP43405 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SYKP43405 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYKP43405 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYKP43405 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYKP43405 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYKP43405 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SYKP43405 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SYKP43405 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYKP43405 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYKP43405 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYKP43405 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYKP43405 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYKP43405 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYKP43405 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SYKP43405 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYKP43405 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYKP43405 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYKP43405 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYKP43405 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYKP43405 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SYKP43405 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYKP43405 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYKP43405 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SYKP43405 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SYKP43405 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SYKP43405 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYKP43405 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYKP43405 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYKP43405 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYKP43405 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYKP43405 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYKP43405 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYKP43405 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYKP43405 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYKP43405 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SYKP43405 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SYKP43405 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYKP43405 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYKP43405 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYKP43405 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYKP43405 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYKP43405 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SYKP43405 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYKP43405 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYKP43405 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYKP43405 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYKP43405 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYKP43405 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYKP43405 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SYKP43405 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SYKP43405 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYKP43405 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYKP43405 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYKP43405 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYKP43405 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYKP43405 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SYKP43405 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SYKP43405 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms