Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NR4A2P43354 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NR4A2P43354 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NR4A2P43354 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms