Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD52P43351 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RAD52P43351 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD52P43351 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD52P43351 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD52P43351 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD52P43351 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD52P43351 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RAD52P43351 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD52P43351 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD52P43351 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD52P43351 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD52P43351 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD52P43351 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD52P43351 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RAD52P43351 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD52P43351 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD52P43351 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD52P43351 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD52P43351 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD52P43351 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RAD52P43351 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD52P43351 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RAD52P43351 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD52P43351 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD52P43351 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD52P43351 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RAD52P43351 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD52P43351 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD52P43351 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD52P43351 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD52P43351 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RAD52P43351 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD52P43351 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD52P43351 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD52P43351 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD52P43351 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD52P43351 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD52P43351 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RAD52P43351 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD52P43351 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD52P43351 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD52P43351 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD52P43351 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD52P43351 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD52P43351 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD52P43351 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD52P43351 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD52P43351 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD52P43351 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD52P43351 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RAD52P43351 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD52P43351 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD52P43351 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD52P43351 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD52P43351 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD52P43351 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD52P43351 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAD52P43351 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD52P43351 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD52P43351 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD52P43351 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD52P43351 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD52P43351 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD52P43351 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD52P43351 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAD52P43351 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD52P43351 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD52P43351 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD52P43351 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD52P43351 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD52P43351 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD52P43351 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD52P43351 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD52P43351 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAD52P43351 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAD52P43351 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD52P43351 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD52P43351 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD52P43351 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD52P43351 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD52P43351 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD52P43351 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAD52P43351 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD52P43351 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD52P43351 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD52P43351 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD52P43351 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD52P43351 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD52P43351 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAD52P43351 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD52P43351 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD52P43351 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD52P43351 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD52P43351 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAD52P43351 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD52P43351 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD52P43351 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD52P43351 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAD52P43351 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms