Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TNFSF9P41273 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TNFSF9P41273 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms