Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM5CP41229 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.7■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.7■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.7■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5CP41229 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
KDM5CP41229 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
KDM5CP41229 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms