Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGCXP38435 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGCXP38435 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GGCXP38435 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGCXP38435 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGCXP38435 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGCXP38435 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGCXP38435 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGCXP38435 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GGCXP38435 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGCXP38435 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGCXP38435 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GGCXP38435 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGCXP38435 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGCXP38435 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGCXP38435 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GGCXP38435 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGCXP38435 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGCXP38435 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGCXP38435 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGCXP38435 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GGCXP38435 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGCXP38435 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGCXP38435 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GGCXP38435 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GGCXP38435 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGCXP38435 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGCXP38435 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GGCXP38435 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GGCXP38435 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGCXP38435 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GGCXP38435 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGCXP38435 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGCXP38435 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GGCXP38435 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGCXP38435 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGCXP38435 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGCXP38435 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GGCXP38435 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGCXP38435 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGCXP38435 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GGCXP38435 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGCXP38435 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGCXP38435 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGCXP38435 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGCXP38435 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GGCXP38435 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGCXP38435 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGCXP38435 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGCXP38435 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGCXP38435 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GGCXP38435 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGCXP38435 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGCXP38435 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGCXP38435 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGCXP38435 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GGCXP38435 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GGCXP38435 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGCXP38435 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGCXP38435 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGCXP38435 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGCXP38435 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGCXP38435 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGCXP38435 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GGCXP38435 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGCXP38435 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGCXP38435 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGCXP38435 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGCXP38435 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGCXP38435 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGCXP38435 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GGCXP38435 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGCXP38435 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GGCXP38435 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGCXP38435 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGCXP38435 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGCXP38435 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGCXP38435 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGCXP38435 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGCXP38435 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GGCXP38435 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGCXP38435 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGCXP38435 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GGCXP38435 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GGCXP38435 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGCXP38435 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGCXP38435 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGCXP38435 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGCXP38435 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGCXP38435 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GGCXP38435 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGCXP38435 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGCXP38435 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GGCXP38435 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GGCXP38435 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GGCXP38435 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GGCXP38435 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GGCXP38435 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GGCXP38435 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GGCXP38435 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms