Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FDFT1P37268 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FDFT1P37268 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FDFT1P37268 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FDFT1P37268 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.5 ms