Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SOX6P35712 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SOX6P35712 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX6P35712 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX6P35712 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX6P35712 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX6P35712 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX6P35712 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX6P35712 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SOX6P35712 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX6P35712 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX6P35712 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX6P35712 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX6P35712 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX6P35712 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX6P35712 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX6P35712 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX6P35712 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX6P35712 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX6P35712 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SOX6P35712 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX6P35712 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX6P35712 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX6P35712 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX6P35712 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX6P35712 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SOX6P35712 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX6P35712 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX6P35712 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX6P35712 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX6P35712 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SOX6P35712 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX6P35712 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX6P35712 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX6P35712 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX6P35712 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX6P35712 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX6P35712 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX6P35712 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX6P35712 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SOX6P35712 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX6P35712 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX6P35712 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX6P35712 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX6P35712 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX6P35712 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX6P35712 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX6P35712 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX6P35712 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SOX6P35712 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX6P35712 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX6P35712 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SOX6P35712 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOX6P35712 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOX6P35712 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SOX6P35712 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SOX6P35712 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX6P35712 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX6P35712 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX6P35712 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX6P35712 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX6P35712 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX6P35712 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX6P35712 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SOX6P35712 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX6P35712 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX6P35712 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX6P35712 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SOX6P35712 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SOX6P35712 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX6P35712 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX6P35712 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX6P35712 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SOX6P35712 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX6P35712 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SOX6P35712 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX6P35712 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX6P35712 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX6P35712 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SOX6P35712 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX6P35712 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SOX6P35712 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX6P35712 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SOX6P35712 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX6P35712 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX6P35712 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX6P35712 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX6P35712 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX6P35712 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX6P35712 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SOX6P35712 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SOX6P35712 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOX6P35712 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX6P35712 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX6P35712 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX6P35712 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX6P35712 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX6P35712 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX6P35712 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX6P35712 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms