Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COPB2P35606 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COPB2P35606 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COPB2P35606 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COPB2P35606 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
COPB2P35606 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COPB2P35606 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COPB2P35606 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COPB2P35606 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COPB2P35606 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COPB2P35606 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COPB2P35606 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
COPB2P35606 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COPB2P35606 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
COPB2P35606 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COPB2P35606 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COPB2P35606 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
COPB2P35606 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COPB2P35606 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COPB2P35606 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COPB2P35606 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COPB2P35606 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COPB2P35606 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COPB2P35606 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
COPB2P35606 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
COPB2P35606 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COPB2P35606 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COPB2P35606 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COPB2P35606 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
COPB2P35606 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
COPB2P35606 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
COPB2P35606 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COPB2P35606 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
COPB2P35606 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COPB2P35606 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COPB2P35606 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COPB2P35606 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
COPB2P35606 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPB2P35606 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPB2P35606 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
COPB2P35606 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
COPB2P35606 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPB2P35606 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPB2P35606 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPB2P35606 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPB2P35606 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPB2P35606 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPB2P35606 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPB2P35606 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPB2P35606 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPB2P35606 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPB2P35606 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPB2P35606 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPB2P35606 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPB2P35606 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COPB2P35606 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COPB2P35606 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
COPB2P35606 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COPB2P35606 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COPB2P35606 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
COPB2P35606 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
COPB2P35606 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COPB2P35606 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COPB2P35606 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
COPB2P35606 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
COPB2P35606 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COPB2P35606 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COPB2P35606 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
COPB2P35606 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COPB2P35606 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
COPB2P35606 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COPB2P35606 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
COPB2P35606 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COPB2P35606 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COPB2P35606 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COPB2P35606 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
COPB2P35606 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COPB2P35606 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.55■■■□□ 2
COPB2P35606 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
COPB2P35606 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
COPB2P35606 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
COPB2P35606 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
COPB2P35606 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COPB2P35606 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COPB2P35606 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COPB2P35606 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COPB2P35606 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
COPB2P35606 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COPB2P35606 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COPB2P35606 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
COPB2P35606 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.53■■■□□ 2
COPB2P35606 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COPB2P35606 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
COPB2P35606 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COPB2P35606 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COPB2P35606 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
COPB2P35606 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COPB2P35606 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
COPB2P35606 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
COPB2P35606 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms