Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RORAP35398 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RORAP35398 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RORAP35398 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORAP35398 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORAP35398 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORAP35398 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORAP35398 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORAP35398 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RORAP35398 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORAP35398 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORAP35398 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORAP35398 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RORAP35398 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RORAP35398 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RORAP35398 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RORAP35398 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RORAP35398 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RORAP35398 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORAP35398 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RORAP35398 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORAP35398 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORAP35398 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RORAP35398 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORAP35398 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORAP35398 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RORAP35398 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RORAP35398 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RORAP35398 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RORAP35398 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORAP35398 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORAP35398 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORAP35398 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORAP35398 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RORAP35398 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORAP35398 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORAP35398 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORAP35398 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORAP35398 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RORAP35398 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RORAP35398 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RORAP35398 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RORAP35398 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RORAP35398 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RORAP35398 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RORAP35398 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RORAP35398 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RORAP35398 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RORAP35398 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RORAP35398 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORAP35398 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORAP35398 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORAP35398 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RORAP35398 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORAP35398 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORAP35398 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORAP35398 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORAP35398 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORAP35398 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RORAP35398 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RORAP35398 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RORAP35398 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RORAP35398 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RORAP35398 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RORAP35398 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RORAP35398 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RORAP35398 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RORAP35398 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORAP35398 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORAP35398 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORAP35398 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORAP35398 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORAP35398 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORAP35398 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RORAP35398 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RORAP35398 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORAP35398 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORAP35398 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORAP35398 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORAP35398 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORAP35398 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORAP35398 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORAP35398 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RORAP35398 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RORAP35398 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RORAP35398 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RORAP35398 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RORAP35398 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RORAP35398 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RORAP35398 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RORAP35398 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RORAP35398 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RORAP35398 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RORAP35398 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORAP35398 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORAP35398 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORAP35398 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORAP35398 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORAP35398 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RORAP35398 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms