Protein–RNA interactions for Protein: P35080

PFN2, Profilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN2P35080 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFN2P35080 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PFN2P35080 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFN2P35080 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFN2P35080 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFN2P35080 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PFN2P35080 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFN2P35080 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFN2P35080 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFN2P35080 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFN2P35080 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFN2P35080 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFN2P35080 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFN2P35080 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFN2P35080 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFN2P35080 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PFN2P35080 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PFN2P35080 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFN2P35080 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFN2P35080 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFN2P35080 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFN2P35080 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PFN2P35080 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFN2P35080 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PFN2P35080 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFN2P35080 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFN2P35080 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFN2P35080 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFN2P35080 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFN2P35080 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFN2P35080 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PFN2P35080 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFN2P35080 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFN2P35080 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFN2P35080 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFN2P35080 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFN2P35080 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PFN2P35080 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFN2P35080 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PFN2P35080 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PFN2P35080 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PFN2P35080 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFN2P35080 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFN2P35080 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFN2P35080 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFN2P35080 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFN2P35080 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFN2P35080 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFN2P35080 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFN2P35080 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFN2P35080 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFN2P35080 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PFN2P35080 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFN2P35080 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFN2P35080 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFN2P35080 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFN2P35080 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PFN2P35080 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFN2P35080 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFN2P35080 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PFN2P35080 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFN2P35080 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFN2P35080 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFN2P35080 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFN2P35080 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFN2P35080 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFN2P35080 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFN2P35080 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PFN2P35080 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms