Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA5P31644 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA5P31644 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA5P31644 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA5P31644 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA5P31644 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA5P31644 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA5P31644 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA5P31644 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GABRA5P31644 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA5P31644 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA5P31644 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA5P31644 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GABRA5P31644 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA5P31644 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA5P31644 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA5P31644 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GABRA5P31644 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA5P31644 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA5P31644 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA5P31644 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA5P31644 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA5P31644 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA5P31644 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA5P31644 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA5P31644 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA5P31644 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GABRA5P31644 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GABRA5P31644 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GABRA5P31644 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms