Protein–RNA interactions for Protein: P30304

CDC25A, M-phase inducer phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25AP30304 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDC25AP30304 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDC25AP30304 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDC25AP30304 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC25AP30304 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC25AP30304 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC25AP30304 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC25AP30304 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDC25AP30304 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC25AP30304 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CDC25AP30304 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC25AP30304 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDC25AP30304 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC25AP30304 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CDC25AP30304 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms