Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJB2P29033 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB2P29033 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJB2P29033 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
GJB2P29033 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB2P29033 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB2P29033 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GJB2P29033 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJB2P29033 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJB2P29033 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJB2P29033 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJB2P29033 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJB2P29033 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJB2P29033 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
GJB2P29033 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJB2P29033 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB2P29033 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB2P29033 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB2P29033 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB2P29033 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB2P29033 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJB2P29033 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB2P29033 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB2P29033 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB2P29033 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB2P29033 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB2P29033 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB2P29033 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB2P29033 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJB2P29033 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB2P29033 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB2P29033 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB2P29033 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB2P29033 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB2P29033 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB2P29033 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB2P29033 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB2P29033 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB2P29033 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB2P29033 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB2P29033 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB2P29033 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJB2P29033 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
GJB2P29033 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GJB2P29033 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJB2P29033 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJB2P29033 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJB2P29033 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJB2P29033 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJB2P29033 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJB2P29033 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GJB2P29033 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJB2P29033 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJB2P29033 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB2P29033 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB2P29033 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB2P29033 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB2P29033 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB2P29033 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB2P29033 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB2P29033 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJB2P29033 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJB2P29033 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJB2P29033 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJB2P29033 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJB2P29033 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJB2P29033 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJB2P29033 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJB2P29033 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB2P29033 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB2P29033 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB2P29033 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB2P29033 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB2P29033 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB2P29033 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB2P29033 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB2P29033 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB2P29033 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB2P29033 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB2P29033 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB2P29033 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJB2P29033 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
GJB2P29033 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJB2P29033 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GJB2P29033 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJB2P29033 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJB2P29033 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJB2P29033 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJB2P29033 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJB2P29033 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJB2P29033 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJB2P29033 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJB2P29033 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJB2P29033 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJB2P29033 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJB2P29033 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJB2P29033 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB2P29033 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB2P29033 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJB2P29033 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms