Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RPA1P27694 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPA1P27694 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPA1P27694 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RPA1P27694 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RPA1P27694 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPA1P27694 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPA1P27694 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPA1P27694 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPA1P27694 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPA1P27694 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPA1P27694 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPA1P27694 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPA1P27694 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RPA1P27694 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPA1P27694 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPA1P27694 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPA1P27694 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPA1P27694 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPA1P27694 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPA1P27694 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPA1P27694 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPA1P27694 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPA1P27694 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPA1P27694 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPA1P27694 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPA1P27694 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPA1P27694 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPA1P27694 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPA1P27694 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPA1P27694 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPA1P27694 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPA1P27694 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPA1P27694 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPA1P27694 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPA1P27694 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPA1P27694 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RPA1P27694 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPA1P27694 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPA1P27694 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPA1P27694 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPA1P27694 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPA1P27694 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPA1P27694 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPA1P27694 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPA1P27694 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RPA1P27694 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPA1P27694 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RPA1P27694 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPA1P27694 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
RPA1P27694 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPA1P27694 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPA1P27694 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RPA1P27694 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPA1P27694 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RPA1P27694 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPA1P27694 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPA1P27694 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPA1P27694 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPA1P27694 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPA1P27694 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RPA1P27694 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPA1P27694 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPA1P27694 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPA1P27694 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPA1P27694 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPA1P27694 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPA1P27694 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPA1P27694 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPA1P27694 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPA1P27694 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPA1P27694 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPA1P27694 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPA1P27694 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPA1P27694 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPA1P27694 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPA1P27694 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPA1P27694 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPA1P27694 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPA1P27694 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RPA1P27694 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPA1P27694 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPA1P27694 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPA1P27694 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPA1P27694 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPA1P27694 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPA1P27694 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPA1P27694 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPA1P27694 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPA1P27694 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPA1P27694 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RPA1P27694 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPA1P27694 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPA1P27694 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPA1P27694 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPA1P27694 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPA1P27694 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPA1P27694 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPA1P27694 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPA1P27694 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms