Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
PLNP26678 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLNP26678 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLNP26678 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLNP26678 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLNP26678 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLNP26678 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLNP26678 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLNP26678 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLNP26678 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
PLNP26678 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLNP26678 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLNP26678 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLNP26678 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PLNP26678 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLNP26678 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLNP26678 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLNP26678 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PLNP26678 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLNP26678 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PLNP26678 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLNP26678 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLNP26678 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLNP26678 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLNP26678 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PLNP26678 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PLNP26678 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLNP26678 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PLNP26678 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PLNP26678 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLNP26678 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLNP26678 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLNP26678 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLNP26678 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLNP26678 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLNP26678 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PLNP26678 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLNP26678 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLNP26678 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLNP26678 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLNP26678 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLNP26678 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLNP26678 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PLNP26678 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLNP26678 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLNP26678 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLNP26678 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLNP26678 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLNP26678 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PLNP26678 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLNP26678 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLNP26678 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLNP26678 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLNP26678 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PLNP26678 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PLNP26678 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLNP26678 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLNP26678 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLNP26678 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLNP26678 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLNP26678 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLNP26678 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLNP26678 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLNP26678 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLNP26678 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLNP26678 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLNP26678 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PLNP26678 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLNP26678 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLNP26678 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLNP26678 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLNP26678 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLNP26678 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLNP26678 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLNP26678 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLNP26678 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLNP26678 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLNP26678 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLNP26678 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLNP26678 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLNP26678 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLNP26678 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLNP26678 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLNP26678 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLNP26678 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLNP26678 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLNP26678 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLNP26678 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLNP26678 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLNP26678 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLNP26678 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLNP26678 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLNP26678 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLNP26678 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLNP26678 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLNP26678 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLNP26678 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLNP26678 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLNP26678 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PLNP26678 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms