Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND1P24385 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND1P24385 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND1P24385 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND1P24385 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND1P24385 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCND1P24385 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCND1P24385 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND1P24385 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND1P24385 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCND1P24385 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND1P24385 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND1P24385 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND1P24385 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND1P24385 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND1P24385 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND1P24385 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND1P24385 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCND1P24385 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND1P24385 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND1P24385 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND1P24385 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND1P24385 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND1P24385 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND1P24385 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND1P24385 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCND1P24385 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCND1P24385 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCND1P24385 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCND1P24385 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CCND1P24385 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCND1P24385 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCND1P24385 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCND1P24385 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCND1P24385 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCND1P24385 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCND1P24385 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCND1P24385 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND1P24385 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND1P24385 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND1P24385 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND1P24385 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCND1P24385 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND1P24385 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND1P24385 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND1P24385 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND1P24385 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND1P24385 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND1P24385 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND1P24385 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCND1P24385 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND1P24385 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND1P24385 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND1P24385 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND1P24385 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCND1P24385 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCND1P24385 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCND1P24385 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCND1P24385 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCND1P24385 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND1P24385 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND1P24385 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND1P24385 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND1P24385 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCND1P24385 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCND1P24385 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCND1P24385 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCND1P24385 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCND1P24385 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCND1P24385 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCND1P24385 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCND1P24385 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCND1P24385 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCND1P24385 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND1P24385 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND1P24385 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND1P24385 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND1P24385 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND1P24385 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCND1P24385 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND1P24385 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND1P24385 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND1P24385 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND1P24385 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCND1P24385 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms