Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATP2B4P23634 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2B4P23634 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATP2B4P23634 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2B4P23634 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATP2B4P23634 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2B4P23634 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2B4P23634 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2B4P23634 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2B4P23634 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2B4P23634 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2B4P23634 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATP2B4P23634 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATP2B4P23634 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
ATP2B4P23634 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATP2B4P23634 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms