Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
HRCP23327 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
HRCP23327 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
HRCP23327 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
HRCP23327 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
HRCP23327 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
HRCP23327 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
HRCP23327 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
HRCP23327 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
HRCP23327 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
HRCP23327 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
HRCP23327 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
HRCP23327 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
HRCP23327 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
HRCP23327 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
HRCP23327 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
HRCP23327 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
HRCP23327 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
HRCP23327 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
HRCP23327 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
HRCP23327 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
HRCP23327 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
HRCP23327 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
HRCP23327 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
HRCP23327 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
HRCP23327 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
HRCP23327 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
HRCP23327 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
HRCP23327 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
HRCP23327 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
HRCP23327 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
HRCP23327 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
HRCP23327 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
HRCP23327 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
HRCP23327 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
HRCP23327 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
HRCP23327 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
HRCP23327 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
HRCP23327 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
HRCP23327 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
HRCP23327 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
HRCP23327 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
HRCP23327 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.11■■■■□ 3.53
HRCP23327 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
HRCP23327 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
HRCP23327 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
HRCP23327 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
HRCP23327 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
HRCP23327 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
HRCP23327 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
HRCP23327 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
HRCP23327 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
HRCP23327 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
HRCP23327 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
HRCP23327 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
HRCP23327 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
HRCP23327 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
HRCP23327 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
HRCP23327 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
HRCP23327 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
HRCP23327 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
HRCP23327 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
HRCP23327 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
HRCP23327 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
HRCP23327 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
HRCP23327 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
HRCP23327 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
HRCP23327 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
HRCP23327 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
HRCP23327 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
HRCP23327 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
HRCP23327 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
HRCP23327 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
HRCP23327 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
HRCP23327 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
HRCP23327 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
HRCP23327 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
HRCP23327 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
HRCP23327 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
HRCP23327 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
HRCP23327 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
HRCP23327 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
HRCP23327 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
HRCP23327 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
HRCP23327 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms