Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MATN1P21941 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN1P21941 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN1P21941 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MATN1P21941 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN1P21941 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN1P21941 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN1P21941 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN1P21941 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MATN1P21941 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN1P21941 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN1P21941 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MATN1P21941 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN1P21941 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN1P21941 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN1P21941 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN1P21941 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MATN1P21941 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MATN1P21941 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN1P21941 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN1P21941 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN1P21941 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MATN1P21941 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MATN1P21941 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MATN1P21941 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN1P21941 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN1P21941 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN1P21941 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MATN1P21941 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN1P21941 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN1P21941 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN1P21941 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN1P21941 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN1P21941 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MATN1P21941 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN1P21941 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN1P21941 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN1P21941 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN1P21941 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN1P21941 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN1P21941 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN1P21941 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN1P21941 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MATN1P21941 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN1P21941 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN1P21941 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN1P21941 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN1P21941 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MATN1P21941 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN1P21941 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN1P21941 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN1P21941 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN1P21941 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN1P21941 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MATN1P21941 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN1P21941 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN1P21941 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MATN1P21941 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN1P21941 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN1P21941 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN1P21941 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN1P21941 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN1P21941 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN1P21941 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MATN1P21941 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MATN1P21941 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MATN1P21941 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MATN1P21941 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MATN1P21941 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MATN1P21941 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MATN1P21941 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MATN1P21941 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MATN1P21941 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MATN1P21941 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MATN1P21941 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MATN1P21941 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MATN1P21941 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MATN1P21941 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MATN1P21941 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MATN1P21941 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms