Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACO1P21399 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACO1P21399 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACO1P21399 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACO1P21399 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACO1P21399 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ACO1P21399 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACO1P21399 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACO1P21399 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACO1P21399 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACO1P21399 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACO1P21399 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACO1P21399 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACO1P21399 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACO1P21399 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACO1P21399 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACO1P21399 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACO1P21399 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACO1P21399 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACO1P21399 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACO1P21399 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACO1P21399 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACO1P21399 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACO1P21399 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACO1P21399 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACO1P21399 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACO1P21399 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACO1P21399 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACO1P21399 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACO1P21399 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACO1P21399 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACO1P21399 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACO1P21399 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACO1P21399 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACO1P21399 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACO1P21399 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACO1P21399 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ACO1P21399 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACO1P21399 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACO1P21399 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACO1P21399 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ACO1P21399 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACO1P21399 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACO1P21399 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACO1P21399 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACO1P21399 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACO1P21399 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACO1P21399 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACO1P21399 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACO1P21399 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACO1P21399 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ACO1P21399 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ACO1P21399 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACO1P21399 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACO1P21399 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACO1P21399 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACO1P21399 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACO1P21399 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACO1P21399 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACO1P21399 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACO1P21399 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACO1P21399 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACO1P21399 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACO1P21399 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACO1P21399 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACO1P21399 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACO1P21399 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACO1P21399 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACO1P21399 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACO1P21399 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACO1P21399 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACO1P21399 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACO1P21399 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACO1P21399 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACO1P21399 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACO1P21399 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACO1P21399 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACO1P21399 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACO1P21399 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACO1P21399 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACO1P21399 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACO1P21399 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACO1P21399 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACO1P21399 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ACO1P21399 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACO1P21399 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACO1P21399 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACO1P21399 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACO1P21399 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACO1P21399 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACO1P21399 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACO1P21399 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ACO1P21399 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACO1P21399 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACO1P21399 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACO1P21399 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACO1P21399 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACO1P21399 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACO1P21399 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACO1P21399 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms