Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDK11BP21127 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDK11BP21127 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CDK11BP21127 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms