Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EFNA1P20827 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EFNA1P20827 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms