Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TFEBP19484 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFEBP19484 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFEBP19484 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFEBP19484 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFEBP19484 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFEBP19484 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TFEBP19484 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFEBP19484 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFEBP19484 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TFEBP19484 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFEBP19484 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFEBP19484 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFEBP19484 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFEBP19484 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFEBP19484 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TFEBP19484 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFEBP19484 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFEBP19484 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFEBP19484 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFEBP19484 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFEBP19484 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFEBP19484 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TFEBP19484 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TFEBP19484 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFEBP19484 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFEBP19484 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFEBP19484 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFEBP19484 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TFEBP19484 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TFEBP19484 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFEBP19484 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFEBP19484 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TFEBP19484 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFEBP19484 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFEBP19484 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFEBP19484 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TFEBP19484 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFEBP19484 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFEBP19484 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFEBP19484 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFEBP19484 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFEBP19484 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFEBP19484 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFEBP19484 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFEBP19484 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFEBP19484 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFEBP19484 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFEBP19484 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFEBP19484 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFEBP19484 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TFEBP19484 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFEBP19484 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFEBP19484 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFEBP19484 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TFEBP19484 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFEBP19484 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFEBP19484 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TFEBP19484 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TFEBP19484 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TFEBP19484 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFEBP19484 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFEBP19484 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFEBP19484 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFEBP19484 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFEBP19484 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFEBP19484 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFEBP19484 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFEBP19484 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFEBP19484 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TFEBP19484 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TFEBP19484 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFEBP19484 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFEBP19484 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TFEBP19484 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFEBP19484 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFEBP19484 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFEBP19484 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TFEBP19484 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFEBP19484 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFEBP19484 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFEBP19484 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFEBP19484 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFEBP19484 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFEBP19484 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TFEBP19484 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFEBP19484 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TFEBP19484 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFEBP19484 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TFEBP19484 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TFEBP19484 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFEBP19484 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFEBP19484 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFEBP19484 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFEBP19484 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFEBP19484 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFEBP19484 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFEBP19484 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFEBP19484 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TFEBP19484 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms