Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ITGB6P18564 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGB6P18564 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGB6P18564 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms