Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERCC2P18074 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ERCC2P18074 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERCC2P18074 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257 ms