Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMD1P17707 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMD1P17707 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMD1P17707 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AMD1P17707 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMD1P17707 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMD1P17707 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMD1P17707 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMD1P17707 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMD1P17707 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMD1P17707 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AMD1P17707 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMD1P17707 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMD1P17707 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMD1P17707 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMD1P17707 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AMD1P17707 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMD1P17707 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
AMD1P17707 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMD1P17707 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMD1P17707 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMD1P17707 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMD1P17707 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMD1P17707 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AMD1P17707 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMD1P17707 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMD1P17707 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMD1P17707 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMD1P17707 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AMD1P17707 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMD1P17707 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMD1P17707 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMD1P17707 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMD1P17707 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMD1P17707 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMD1P17707 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMD1P17707 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMD1P17707 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMD1P17707 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMD1P17707 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMD1P17707 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMD1P17707 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMD1P17707 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMD1P17707 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMD1P17707 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMD1P17707 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMD1P17707 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AMD1P17707 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMD1P17707 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMD1P17707 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMD1P17707 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMD1P17707 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMD1P17707 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMD1P17707 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMD1P17707 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMD1P17707 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMD1P17707 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMD1P17707 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMD1P17707 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMD1P17707 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMD1P17707 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMD1P17707 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMD1P17707 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AMD1P17707 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMD1P17707 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMD1P17707 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMD1P17707 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMD1P17707 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMD1P17707 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMD1P17707 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMD1P17707 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AMD1P17707 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMD1P17707 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMD1P17707 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AMD1P17707 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMD1P17707 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMD1P17707 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMD1P17707 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMD1P17707 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMD1P17707 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMD1P17707 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMD1P17707 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMD1P17707 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMD1P17707 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AMD1P17707 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMD1P17707 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMD1P17707 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AMD1P17707 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMD1P17707 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AMD1P17707 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMD1P17707 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMD1P17707 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMD1P17707 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMD1P17707 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AMD1P17707 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AMD1P17707 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AMD1P17707 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
AMD1P17707 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMD1P17707 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AMD1P17707 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms