Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CKMT2P17540 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKMT2P17540 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKMT2P17540 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CKMT2P17540 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms