Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMPD1P17405 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMPD1P17405 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMPD1P17405 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms