Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA1P17302 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA1P17302 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA1P17302 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GJA1P17302 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA1P17302 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GJA1P17302 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA1P17302 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA1P17302 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA1P17302 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA1P17302 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA1P17302 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GJA1P17302 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA1P17302 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA1P17302 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA1P17302 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA1P17302 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA1P17302 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA1P17302 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA1P17302 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA1P17302 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GJA1P17302 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA1P17302 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA1P17302 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GJA1P17302 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA1P17302 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA1P17302 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA1P17302 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA1P17302 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA1P17302 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GJA1P17302 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA1P17302 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GJA1P17302 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA1P17302 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA1P17302 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA1P17302 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA1P17302 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GJA1P17302 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA1P17302 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GJA1P17302 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA1P17302 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA1P17302 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA1P17302 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA1P17302 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA1P17302 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA1P17302 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA1P17302 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA1P17302 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA1P17302 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GJA1P17302 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA1P17302 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA1P17302 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GJA1P17302 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA1P17302 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA1P17302 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GJA1P17302 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA1P17302 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA1P17302 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA1P17302 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA1P17302 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GJA1P17302 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA1P17302 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA1P17302 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA1P17302 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA1P17302 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GJA1P17302 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA1P17302 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA1P17302 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA1P17302 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA1P17302 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GJA1P17302 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJA1P17302 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJA1P17302 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJA1P17302 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJA1P17302 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GJA1P17302 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA1P17302 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA1P17302 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA1P17302 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA1P17302 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GJA1P17302 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA1P17302 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA1P17302 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA1P17302 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA1P17302 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA1P17302 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA1P17302 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA1P17302 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GJA1P17302 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA1P17302 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA1P17302 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GJA1P17302 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA1P17302 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA1P17302 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA1P17302 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA1P17302 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA1P17302 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GJA1P17302 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA1P17302 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GJA1P17302 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.9 ms