Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKCAP17252 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRKCAP17252 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRKCAP17252 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRKCAP17252 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms