Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRA1P14867 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABRA1P14867 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABRA1P14867 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms