Protein–RNA interactions for Protein: P12955

PEPD, Xaa-Pro dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEPDP12955 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEPDP12955 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEPDP12955 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEPDP12955 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PEPDP12955 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEPDP12955 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEPDP12955 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEPDP12955 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEPDP12955 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEPDP12955 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEPDP12955 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEPDP12955 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEPDP12955 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEPDP12955 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEPDP12955 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEPDP12955 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEPDP12955 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEPDP12955 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEPDP12955 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEPDP12955 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEPDP12955 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEPDP12955 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEPDP12955 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEPDP12955 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PEPDP12955 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEPDP12955 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PEPDP12955 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEPDP12955 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEPDP12955 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEPDP12955 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEPDP12955 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEPDP12955 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEPDP12955 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PEPDP12955 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PEPDP12955 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PEPDP12955 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PEPDP12955 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEPDP12955 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEPDP12955 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEPDP12955 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEPDP12955 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEPDP12955 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEPDP12955 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEPDP12955 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEPDP12955 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEPDP12955 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEPDP12955 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PEPDP12955 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEPDP12955 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEPDP12955 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEPDP12955 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEPDP12955 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PEPDP12955 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEPDP12955 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEPDP12955 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PEPDP12955 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEPDP12955 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEPDP12955 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEPDP12955 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEPDP12955 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEPDP12955 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEPDP12955 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEPDP12955 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEPDP12955 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEPDP12955 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PEPDP12955 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PEPDP12955 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PEPDP12955 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEPDP12955 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEPDP12955 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PEPDP12955 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEPDP12955 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEPDP12955 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEPDP12955 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEPDP12955 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PEPDP12955 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PEPDP12955 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEPDP12955 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEPDP12955 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEPDP12955 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEPDP12955 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PEPDP12955 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEPDP12955 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PEPDP12955 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PEPDP12955 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PEPDP12955 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PEPDP12955 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PEPDP12955 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEPDP12955 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PEPDP12955 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEPDP12955 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEPDP12955 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEPDP12955 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEPDP12955 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEPDP12955 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEPDP12955 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEPDP12955 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PEPDP12955 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEPDP12955 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PEPDP12955 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms