Protein–RNA interactions for Protein: P12882

MYH1, Myosin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH1P12882 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYH1P12882 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MYH1P12882 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
MYH1P12882 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYH1P12882 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYH1P12882 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYH1P12882 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MYH1P12882 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYH1P12882 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYH1P12882 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MYH1P12882 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MYH1P12882 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYH1P12882 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYH1P12882 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYH1P12882 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYH1P12882 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYH1P12882 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MYH1P12882 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYH1P12882 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYH1P12882 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYH1P12882 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MYH1P12882 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYH1P12882 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYH1P12882 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MYH1P12882 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYH1P12882 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYH1P12882 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYH1P12882 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYH1P12882 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYH1P12882 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYH1P12882 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYH1P12882 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYH1P12882 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYH1P12882 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYH1P12882 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYH1P12882 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYH1P12882 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYH1P12882 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYH1P12882 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYH1P12882 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYH1P12882 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYH1P12882 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYH1P12882 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH1P12882 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH1P12882 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH1P12882 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH1P12882 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH1P12882 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH1P12882 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH1P12882 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH1P12882 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MYH1P12882 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYH1P12882 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYH1P12882 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYH1P12882 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYH1P12882 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYH1P12882 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYH1P12882 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYH1P12882 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYH1P12882 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYH1P12882 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYH1P12882 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYH1P12882 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MYH1P12882 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYH1P12882 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MYH1P12882 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYH1P12882 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYH1P12882 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYH1P12882 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYH1P12882 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYH1P12882 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYH1P12882 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MYH1P12882 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYH1P12882 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYH1P12882 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYH1P12882 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYH1P12882 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYH1P12882 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MYH1P12882 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYH1P12882 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYH1P12882 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYH1P12882 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYH1P12882 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYH1P12882 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYH1P12882 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYH1P12882 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MYH1P12882 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH1P12882 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH1P12882 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH1P12882 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MYH1P12882 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH1P12882 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH1P12882 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH1P12882 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MYH1P12882 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH1P12882 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH1P12882 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH1P12882 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH1P12882 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MYH1P12882 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms