Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BMP3P12645 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BMP3P12645 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BMP3P12645 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BMP3P12645 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BMP3P12645 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BMP3P12645 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BMP3P12645 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BMP3P12645 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BMP3P12645 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BMP3P12645 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BMP3P12645 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BMP3P12645 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BMP3P12645 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BMP3P12645 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BMP3P12645 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BMP3P12645 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BMP3P12645 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BMP3P12645 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BMP3P12645 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BMP3P12645 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BMP3P12645 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BMP3P12645 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BMP3P12645 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BMP3P12645 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BMP3P12645 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BMP3P12645 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BMP3P12645 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BMP3P12645 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BMP3P12645 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BMP3P12645 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BMP3P12645 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BMP3P12645 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BMP3P12645 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BMP3P12645 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BMP3P12645 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BMP3P12645 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BMP3P12645 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BMP3P12645 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BMP3P12645 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BMP3P12645 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BMP3P12645 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BMP3P12645 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BMP3P12645 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BMP3P12645 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BMP3P12645 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BMP3P12645 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BMP3P12645 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BMP3P12645 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BMP3P12645 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BMP3P12645 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BMP3P12645 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BMP3P12645 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BMP3P12645 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BMP3P12645 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BMP3P12645 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BMP3P12645 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
BMP3P12645 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BMP3P12645 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BMP3P12645 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BMP3P12645 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BMP3P12645 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BMP3P12645 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BMP3P12645 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BMP3P12645 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BMP3P12645 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BMP3P12645 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BMP3P12645 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BMP3P12645 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BMP3P12645 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BMP3P12645 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BMP3P12645 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BMP3P12645 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BMP3P12645 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BMP3P12645 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BMP3P12645 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BMP3P12645 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BMP3P12645 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BMP3P12645 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BMP3P12645 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BMP3P12645 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BMP3P12645 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BMP3P12645 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BMP3P12645 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BMP3P12645 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BMP3P12645 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BMP3P12645 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BMP3P12645 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BMP3P12645 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BMP3P12645 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BMP3P12645 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
BMP3P12645 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BMP3P12645 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BMP3P12645 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BMP3P12645 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BMP3P12645 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BMP3P12645 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BMP3P12645 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BMP3P12645 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BMP3P12645 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms