Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RARAP10276 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RARAP10276 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARAP10276 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARAP10276 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARAP10276 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RARAP10276 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARAP10276 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RARAP10276 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARAP10276 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARAP10276 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARAP10276 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARAP10276 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARAP10276 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARAP10276 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARAP10276 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RARAP10276 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARAP10276 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARAP10276 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARAP10276 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARAP10276 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARAP10276 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RARAP10276 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RARAP10276 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RARAP10276 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARAP10276 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARAP10276 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RARAP10276 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARAP10276 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RARAP10276 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARAP10276 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARAP10276 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARAP10276 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARAP10276 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RARAP10276 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RARAP10276 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARAP10276 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RARAP10276 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARAP10276 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RARAP10276 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARAP10276 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARAP10276 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARAP10276 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RARAP10276 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARAP10276 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARAP10276 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARAP10276 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARAP10276 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARAP10276 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RARAP10276 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARAP10276 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARAP10276 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARAP10276 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARAP10276 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RARAP10276 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RARAP10276 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RARAP10276 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RARAP10276 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARAP10276 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARAP10276 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RARAP10276 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RARAP10276 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RARAP10276 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARAP10276 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARAP10276 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARAP10276 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARAP10276 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RARAP10276 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARAP10276 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARAP10276 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RARAP10276 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RARAP10276 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARAP10276 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARAP10276 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARAP10276 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARAP10276 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARAP10276 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARAP10276 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARAP10276 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARAP10276 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARAP10276 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RARAP10276 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARAP10276 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARAP10276 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARAP10276 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RARAP10276 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RARAP10276 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RARAP10276 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RARAP10276 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARAP10276 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARAP10276 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARAP10276 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARAP10276 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARAP10276 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARAP10276 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARAP10276 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RARAP10276 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARAP10276 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARAP10276 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RARAP10276 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms