Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
GLI3P10071 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
GLI3P10071 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
GLI3P10071 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
GLI3P10071 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GLI3P10071 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
GLI3P10071 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
GLI3P10071 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
GLI3P10071 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GLI3P10071 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GLI3P10071 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GLI3P10071 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
GLI3P10071 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
GLI3P10071 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GLI3P10071 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GLI3P10071 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GLI3P10071 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
GLI3P10071 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
GLI3P10071 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
GLI3P10071 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
GLI3P10071 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GLI3P10071 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
GLI3P10071 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
GLI3P10071 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GLI3P10071 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GLI3P10071 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
GLI3P10071 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI3P10071 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI3P10071 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI3P10071 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI3P10071 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI3P10071 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
GLI3P10071 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GLI3P10071 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GLI3P10071 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
GLI3P10071 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
GLI3P10071 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI3P10071 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI3P10071 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI3P10071 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
GLI3P10071 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GLI3P10071 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
GLI3P10071 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
GLI3P10071 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI3P10071 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI3P10071 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI3P10071 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
GLI3P10071 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GLI3P10071 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GLI3P10071 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
GLI3P10071 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
GLI3P10071 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
GLI3P10071 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
GLI3P10071 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
GLI3P10071 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
GLI3P10071 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GLI3P10071 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GLI3P10071 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
GLI3P10071 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GLI3P10071 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
GLI3P10071 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
GLI3P10071 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
GLI3P10071 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GLI3P10071 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
GLI3P10071 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
GLI3P10071 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
GLI3P10071 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
GLI3P10071 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
GLI3P10071 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
GLI3P10071 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GLI3P10071 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
GLI3P10071 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
GLI3P10071 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GLI3P10071 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
GLI3P10071 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
GLI3P10071 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
GLI3P10071 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GLI3P10071 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GLI3P10071 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
GLI3P10071 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
GLI3P10071 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
GLI3P10071 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
GLI3P10071 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GLI3P10071 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GLI3P10071 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
GLI3P10071 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
GLI3P10071 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GLI3P10071 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GLI3P10071 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GLI3P10071 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GLI3P10071 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GLI3P10071 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
GLI3P10071 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
GLI3P10071 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GLI3P10071 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GLI3P10071 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GLI3P10071 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GLI3P10071 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GLI3P10071 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GLI3P10071 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms