Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCDC166P0CW27 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC166P0CW27 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC166P0CW27 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms