Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MSL3P1P0C860 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MSL3P1P0C860 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MSL3P1P0C860 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSL3P1P0C860 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms