Protein–RNA interactions for Protein: P07384

CAPN1, Calpain-1 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN1P07384 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN1P07384 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN1P07384 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN1P07384 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPN1P07384 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN1P07384 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN1P07384 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN1P07384 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CAPN1P07384 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN1P07384 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN1P07384 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN1P07384 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN1P07384 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN1P07384 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPN1P07384 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAPN1P07384 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPN1P07384 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN1P07384 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPN1P07384 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms