Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ITGB1P05556 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ITGB1P05556 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ITGB1P05556 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ITGB1P05556 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms