Protein–RNA interactions for Protein: P04278

SHBG, Sex hormone-binding globulin, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBGP04278 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHBGP04278 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHBGP04278 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHBGP04278 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHBGP04278 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHBGP04278 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHBGP04278 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHBGP04278 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SHBGP04278 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SHBGP04278 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHBGP04278 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SHBGP04278 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHBGP04278 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHBGP04278 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHBGP04278 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHBGP04278 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHBGP04278 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHBGP04278 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SHBGP04278 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHBGP04278 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHBGP04278 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHBGP04278 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHBGP04278 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHBGP04278 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHBGP04278 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHBGP04278 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHBGP04278 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SHBGP04278 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHBGP04278 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHBGP04278 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHBGP04278 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHBGP04278 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHBGP04278 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SHBGP04278 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHBGP04278 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHBGP04278 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHBGP04278 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHBGP04278 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHBGP04278 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHBGP04278 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHBGP04278 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHBGP04278 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHBGP04278 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHBGP04278 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHBGP04278 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SHBGP04278 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHBGP04278 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHBGP04278 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHBGP04278 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHBGP04278 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHBGP04278 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHBGP04278 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHBGP04278 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHBGP04278 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHBGP04278 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHBGP04278 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHBGP04278 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHBGP04278 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHBGP04278 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHBGP04278 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHBGP04278 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHBGP04278 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHBGP04278 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHBGP04278 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHBGP04278 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SHBGP04278 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SHBGP04278 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SHBGP04278 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHBGP04278 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHBGP04278 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHBGP04278 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHBGP04278 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHBGP04278 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHBGP04278 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHBGP04278 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHBGP04278 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHBGP04278 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SHBGP04278 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHBGP04278 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHBGP04278 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHBGP04278 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHBGP04278 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SHBGP04278 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHBGP04278 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHBGP04278 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHBGP04278 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHBGP04278 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHBGP04278 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHBGP04278 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHBGP04278 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SHBGP04278 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHBGP04278 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHBGP04278 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHBGP04278 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHBGP04278 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHBGP04278 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHBGP04278 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SHBGP04278 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHBGP04278 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SHBGP04278 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms